1984年12月15日，我校高教研究室成立，是独立建制的处级单位。高教研究室成立后，于1986年，成立了学校高等教育学会，并召开了三届学术年会。1988年创办《吉林中医教育》杂志。  

1993年，学校内部管理体制改革，进行党政机关机构调整，高教研究室并入教务处。《吉林中医教育》杂志2001年停刊，共出刊34期。  

2015年，学校成立高等教育研究中心、教学质量监控与评价中心，为独立建制的处级单位。经研究，恢复成立高等教育学会，恢复《吉林中医教育》杂志。